По мнению Михаила Ходорковского, в стране суд должен быть независимым, не подчиненным ни «телефонному праву», ни «логике коррупции», иначе не будут работать никакие законы и никакие решения власти. Свои предложения экс-глава «Юкоса» высказал в статье, которую публикует «Коммерсант-Власть».

Михаил Ходорковский считает, что необходимо передать самому судейскому сообществу такие вопросы, как формирование половины состава всех трех высших судов. К судьям необходимо повысить требования, связанные с возрастным и образовательным цензом, восстановить принцип несменяемости судей. Также он предлагает ввести частичную неприкосновенность судей. «Мы должны добиваться, чтобы судьи стали профессиональной корпорацией, независимой от внешних воздействий, административных или коррупционных», - указывает автор статьи.

Исполнительную власть следует избавить от бремени назначения глав судов – председателей и зампредов себе должны выбирать сами судьи Конституционного, Верховного и Высшего Арбитражного судов, считает Михаил Ходорковский. Он также предлагает, чтобы дела между судьями распределялись по жребию – «антикоррупционный потенциал подобной меры очевиден».

Бывший глава «Юкоса» считает, что следует расширить сферу компетенции суда присяжных. Он называет одной из главных исторических проблем с демократией в России так и несложившийся «институт суда, который давал бы равные шансы хозяину и слуге, сильному и слабому, государству и его подданному».

За время заточения Михаила Ходорковского это уже его пятая крупная статья, с удовольствием самый известный заключенный страны дает интервью. В частности в конце мая в интервью деловой немецкой газете Handelsblatt экс-глава компании «Юкос» наряду с критикой по поводу своего судебного процесса, предрек России скорое завершение нефтяного бума, которое способно привести к краху существующей сырьевой модели экономики.

Сейчас Хамовнический суд Москвы рассматривает второе уголовное дело против Михаила Ходорковского и бывшего главы «Менатепа» Платона Лебедева. Их обвиняют в легализации 450 млрд рублей и $7,5 млрд с 1998-го по 2004 год. Обвинения связаны с хищением акций, принадлежащих государству, а также с присвоением нефти и легализацией средств, вырученных от ее продажи. Михаил Ходорковский в 2005 году уже был осужден на 8 лет за финансовые махинации и уклонение от уплаты налогов.

Михаил Ходорковский и Платон Лебедев свою вину по инкриминируемым им преступлениям в рамках второго уголовного дела не признают.