Поскольку, как сообщается, П.Хомяков пошел на то, чтобы заключить сделку со следствием и полностью признал вину, дело рассматривалось судом в особом порядке. Во время судебных прений Хомяков попросил суд о наказании, которое бы не было связано с лишением свободы, в то время, как прокурор потребовал назначить Хомякову шесть лет колонии и штраф в размере трехсот тысяч руб. в пользу государства.
Ранее, по этому же делу, были осуждены сообщники Хомякова Антон Мухачев и Олег Трошкин, которые получили срок в девять и пять лет соответственно.
По версии следствия, помимо экстремизма, Петр Хомяков, «используя свое служебное положение - должность заместителя начальника отдела геоэкологических изысканий ООО «Спецметропроект», совершил хищение денежных средств данной организации на сумму порядка 3,5 млн рублей».
