Уход прокурора с должности связывают с его конфликтом с львовской газетой «Экспресс», который длится уже более года. Пиком противостояния стала публикация в июне материалов журналистского расследования «Экспресса» о том, каким автомобилем пользуется господин Баганец. В ответ он обратился к генеральному прокурору Александру Медведько с просьбой провести проверку относительно незаконного сбора и распространения информации журналистами «Экспресса». «Журналисты не воевали с прокурором. Мы напечатали серию статей о деятельности сотрудников прокуратуры, затем 16 июня этого года вышел материал о расходах самого Алексея Баганца под названием «Лексусовый прокурор». Если господин Баганец понял, что лучше быть честным, то наши труды не прошли даром»,– сказал главный редактор газеты «Экспресс» Игорь Починок.

Председатель Львовской областной государственной администрации Василий Горбаль считает, что конфликт с газетой не мог быть единственной причиной увольнения Алексея Баганца. Вместе с тем губернатор отметил, что «конфликт стал фоновой причиной, подтолкнувшей прокурора написать рапорт». Как рассказал Василий Горбаль, он уже обсудил с господином Баганцом его отставку. «Он был спокоен, сообщил, что принял такое решение, поскольку кадровые ротации неизбежны,– отметил председатель областной госадминистрации.– Я считаю, что его уход связан с новыми назначениями в областных прокуратурах. 12 июля прокурор области попрощается с коллективом и, возможно, сделает публичное заявление по этому поводу».